علمی پژوهان، جلد ۲۰، شماره ۳، صفحات ۱۸۸-۱۹۳
عنوان فارسی بررسی بیوانفورماتیک اختصاصیت miR-۲۲۲-۳p در اتصال به ژن های درگیر در لوسمی لنفوبلاستیک حاد در کودکان
چکیده فارسی مقاله سابقه و هدف: لوسمی لنفوسیتی حاد (Acute lymphocytic leukemia) ALL، نوعی سرطان است که بر روی سلول‌های سفید خون تأثیر می‌گذارد. این بیماری به سرعت پیشرفت می‌کند و نیاز به درمان فوری دارد. لوسمی لنفوبلاستیک حاد، شایع‌ترین نوع لوسمی است که کودکان را تحت تأثیر قرار می‌دهد. در خلال این بیماری افزایش مولکول miR-222-3p مشاهده شده است. از روش ریزآرایه می‌توان برای بررسی اتصالات این miRNA و ژن‌های هدف استفاده کرد، که این مورد با محدودیت‌هایی روبه‌رو است. بر همین اساس، در این مطالعه، از روش‌های کامپیوتری و بیوانفورماتیکی توسط نرم‌افزارهای مختلف و اختصاصی استفاده شد. مواد و روش‌‌ها: ژن‌های هدف با استفاده از الگوریتم‌های مختلف موجود در پایگاه‌های Mirbase، TargetScan، NCBI و RNAhybrid مشخص شدند و بر اساس امتیازات به دست آمده، اهداف دارای بالاترین تمایل شناسایی شدند. یافته‌ها: یافته‌های این مطالعه نشان داد که ژن‌های CDH4، AJAP1، HNRNPA0، UBN1 و ZNF618 به عنوان اهداف بالقوه با اختصاصیت بالاتری برای miR-222-3p می‌باشند. نتیجه‌گیری: دو عامل میزان انرژی آزاد منفی و تعداد جفت بازهای تشکیل شده بین miRNA و UTR-3' ژن‌های مختلف در انتخاب اهداف با اختصاصیت و تمایل بالاتر نقش دارند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله miRNA، لوسمی لنفوبلاستیک حاد، بیوانفورماتیک، miR-222-3p
عنوان انگلیسی Bioinformatic Evaluation of miR-222-3p Specificity in Binding to Genes Involved in Acute Lymphoblastic Leukemia in Children
چکیده انگلیسی مقاله Background and Objectives: Acute lymphocytic leukemia (ALL) is a type of cancer that affects white blood cells. The disease progresses rapidly mandating immediate treatment. ALL is the most common type of leukemia affecting children. An increase in the miR-222-3p molecule has been observed in the course of this disease. The microarray method can be used to examine the binding of this miRNA and target genes, which is not without limitations. Hence, the present study deployed computer and bioinformatics methods with different specialized software. Materials and Methods: Target genes were identified using different algorithms available in Mirbase, TargetScan, NCBI and RNAhybrid databases, and based on the scores obtained, the targets with the highest affinity were identified. Results: The findings of this study showed that the CDH4, AJAP1, HNRNPA0, UBN1 and ZNF618 genes are potential targets with higher specificity for miR-222-3p. Conclusions: Factors involved in selecting targets with high specificity and affinity is dependent on the amount of negative free energy and the number of base pairs formed between miRNA and 3'-UTR of different genes.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله miRNA, Acute lymphocytic leukemia, Bioinformatics, miR-222-3p
نویسندگان مقاله محمد طاهری | Mohammad Taheri
Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
گروه میکروبیولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان،، همدان، ایران

فاطمه خاوری | Fatemeh Khavari
Student Research Committee, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران

پژمان مولائی | Pejman Molaei
Student Research Committee, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران

پریسا حبیبی | Parisa Habibi
Neurophysiology Research Center, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
مرکز تحقیقات نوروفیزیولوژی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران

فاطمه نوری | Fatemeh Nouri
Department of Pharmaceutical Biotechnology, School of Pharmacy, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran
گروه بیوتکنولوژی دارویی، دانشکده داروسازی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران

نشانی اینترنتی http://psj.umsha.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-985-1&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده علوم پایه
نوع مقاله منتشر شده مقاله پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات